Sivil savunmadan sorumlu kurumların yanı sıra Federal Ordu da gerektiğinde Almanya vatandaşlarının korunmasına önemli katkılarda bulunabilir. Felaketlerde ya da diğer büyük olaylarda ikincil yardım burada özellikle önemlidir. Sorumlu sivil savunma makamları, bu tür olaylarla mücadele ederken Federal Ordu'nun yardımına ihtiyaç duyduklarını fark ederlerse, idari yardım talebinin bir parçası olarak personel veya malzeme şeklinde destek talep edebilirler.

Sorumlu askeri ve sivil makamlar arasındaki düzenli ve seviyeye uygun koordinasyon, gerektiğinde Federal Ordu tarafından sağlanacak olası destek hizmetleri konusunda netlik sağlanması açısından büyük önem taşımaktadır. Bundeswehr'in eyalet komutanlığı, bölge irtibat komutanlığı (BVK) ve bölge irtibat komutanlığı (KVK) olarak dikey örgütlenmesi, Bavyera afet kontrol makamlarının Bavyera Eyaleti İçişleri, Spor ve Entegrasyon Bakanlığı, ilçe hükümetleri ve ilçe idari makamları olarak örgütlenmesine esasen karşılık gelmektedir. Olası konuşlanma senaryolarına ilişkin somut planlamanın yanı sıra, ortak çıkarları ilgilendiren tüm konularda bilgi alışverişini kolaylaştırmak da amaçlanmaktadır.

Yedek askerler sivil-asker işbirliğinde kilit bir rol oynamaktadır. Sivil-asker işbirliği için Bundeswehr temsilcileri (BeaBwZMZ) olarak, sivil makamlara ve kuruluşlara askeri afet yardımı ile ilgili tüm konularda danışmanlık yaparlar. Bavyera Eyaleti'nde, ilçelerdeki ve bağımsız şehirlerdeki bölge irtibat komutanlıklarından ve Bavyera Eyalet Komutanlığı tarafından yönetilen idari bölgelerdeki bölge irtibat komutanlıklarından sorumludurlar. Bu da onları ilçe yöneticileri, belediye başkanları ve ilçe başkanları için irtibat noktası haline getirmekte ve askeri ve sivil taraflar arasında önemli bir arabulucu rolünü yerine getirmektedirler.